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      定量蛋白質組 ? 4D-DIA定量蛋白質組學

      · 產品定義

      4D-蛋白質組學是基于timsTOF Pro質譜儀,通過捕集離子淌度(TIMS)與同步累積連續碎裂(PASEF)掃描模式進行差異定量蛋白質組學研究。該技術核心是在傳統3D分離(保留時間、質荷比、離子強度)基礎上,增加肽段的碰撞截面積(CCS),實現第4維度(離子淌度)的分離檢測。 4D-DIA蛋白質組學是基于timsTOF Pro離子淌度平臺的DIA技術,通過數據非依賴采集-同步累積連續碎裂(diaPASEF)掃描模式進行差異定量蛋白質組學分析。將DIA技術與基于timsTOF Pro上的diaPASEF技術相結合,具有高掃描速度和高靈敏度優勢的同時,外加第四維離子淌度分離,使DIA數據在采集時不犧牲窗口循環速度的同時,降低譜圖復雜度和提高離子利用率,實現了蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

       

      · 技術路線

      技術路線 

            

      · 技術優勢

      1. 4D技術加持,更加適合微量樣本;

      2. 克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制,靈活方便;

      3. 采用布魯克的timsTOF Pro質譜平臺,檢測速度提升近一倍。

       

      · 數據分析

      標準數據分析內容

      鑒定分析

      鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖

      表達差異分析

      差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖;

      多組的比較分析(組別>=3

      mufzz聚類;雷達圖;箱線圖

      功能分析

      亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析

      質量控制分析

      肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布

      高級數據分析

      功能分析

      GSEA富集分析

      臨床藥物研究

      藥物靶點注釋

      標志物篩選

      集成機器學習

      與臨床表征的聯合分析

      熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析

      關于個性化數據分析需求,請來電咨詢

       

      部分數據分析結果展示

      部分數據分析結果展示

       

      · 推薦組合產品

      大分子專屬平臺,質量與效率雙重保障:4D-DIA + 4D-DIA磷酸化蛋白質組

       

      · 推薦應用領域

      1. 藥物應答、基因敲除/過表達的蛋白表達譜分析

      2. 植物、微生物生長發育與脅迫逆境生理研究

      3. 疾病生物標志物與藥物作用靶點高通量分析

      4. 蛋白作用機制與特殊功能蛋白質篩選

      5. 各種物種的蛋白質組草圖構建

       

      · 送樣建議(特殊樣本可直接咨詢021-5466-5263/400-066-6761) 

      樣品類型

      推薦樣本量

      (新建Library

      推薦樣本量

      (不建Library

      動物組織類

      常規動物組織(腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉、皮膚等)

      30mg-2g

      15-2mg

      植物組織類

      柔軟組織(木本植物的葉、花等,草本科植物,藻類,蕨類植物,大型真菌等)

      100mg-2g

      50mg-2g

      微生物類

      菌類

      50mg-2g

      20mg-2g

      細胞樣品

      懸浮/貼壁培養細胞

      1-10× 10^7

      0.5-10× 10^7

      體液樣本

      血清/血漿

      0.1ml-0.2ml

      0.05ml-0.2ml

      外泌體

      血漿(未提取外泌體)

      4ml

      2ml

      提取完成的外泌體

      50μg

      20μg

      其他類

      細胞上清

      5ml-10ml

      2ml-5ml

       

      · 參考文獻

      1. Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. Nat Commun. 2020.

      4D-DIA-人尿液-新冠病毒早期感染機制

      2. diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition. Nat Methods. 2020.

      4D-DIA技術原理介紹:diaPASEF

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