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      定量蛋白質組 ? 4D-label free定量蛋白質組學

      · 產品定義

      4D-label free蛋白質組學是基于timsTOF Pro離子淌度平臺的非標記定量蛋白組學技術,通過數據依賴性采集-同步累積連續碎裂(ddaPASEF)掃描模式進行差異定量蛋白質組學分析。該技術是對傳統label free蛋白質組學的升級,其核心是將數據依賴采集(DDA)與同步累積連續碎裂(PASEF)相結合,外加第四維度的離子淌度分離(基于肽段的碰撞截面積CCS),提高離子利用率和準確度,以更少上樣量、更快掃描速度,實現蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

       

      · 技術路線

      技術路線

       

      · 技術優勢

      1. 4D技術加持,更加適合微量樣本

      2. 可用于不同物種間的“有無差異蛋白”比較

      3. 無標記定量蛋白質組學中的倍數壓縮

      4. 克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制,靈活方便

      5. 采用布魯克的timsTOF Pro/Pro2質譜平臺,檢測速度提升近一倍

       

      · 數據分析

      標準數據分析內容

      鑒定分析

      鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖

      表達差異分析

      差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖;

      多組的比較分析(組別>=3

      mufzz聚類;雷達圖;箱線圖

      功能分析

      亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析

      質量控制分析

      肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布

      高級數據分析

      功能分析

      GSEA富集分析

      臨床藥物研究

      藥物靶點注釋

      標志物篩選

      集成機器學習

      與臨床表征的聯合分析

      熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析

      關于個性化數據分析需求,請來電咨詢

       

      · 推薦組合產品

      組學“黃金”聯合:4D-label free + 4D-label free磷酸化蛋白質組

       

      · 推薦應用領域

      1. 藥物應答、基因敲除/過表達的蛋白表達譜分析

      2. 植物、微生物生長發育與脅迫逆境生理研究

      3. 疾病生物標志物與藥物作用靶點高通量分析

      4. 蛋白作用機制與特殊功能蛋白質篩選

      5. 各種物種的蛋白質組草圖構建

      6. 適合臨床微量樣本檢測,如:外泌體、FFPE石蠟切片、活檢穿刺組織等

       

      · 送樣建議(特殊樣本可直接咨詢021-5466-5263/400-066-6761)

      樣品類型

      推薦樣本量

      (新建Library

      推薦樣本量

      (不建Library

      動物組織類

      常規動物組織(腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉、皮膚等)

      30mg-2g

      15-2mg

      植物組織類

      柔軟組織(木本植物的葉、花等,草本科植物,藻類,蕨類植物,大型真菌等)

      100mg-2g

      50mg-2g

      微生物類

      菌類

      50mg-2g

      20mg-2g

      細胞樣品

      懸浮/貼壁培養細胞

      1-10× 10^7

      0.5-10× 10^7

      體液樣本

      血清/血漿

      0.1ml-0.2ml

      0.05ml-0.2ml

      外泌體

      血漿(未提取外泌體)

      4ml

      2ml

      提取完成的外泌體

      50μg

      20μg

      其他類

      細胞上清

      5ml-10ml

      2ml-5ml

       

      ·  參考文獻

      1. A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity.Cell.2022

      利用4D蛋白組學技術、單細胞測序等多種組學技術,系統分析不同嚴重程度的 COVID-19患者的多組學血液圖譜,并與流感和敗血癥患者與健康志愿者進行綜合比較分析

      2. Synergistically Bifunctional Paramagnetic Separation Enables Efficient Isolation of Urine Extracellular Vesicles and Downstream Phosphoproteomic Analysis. ACS Appl Mater Interfaces. 2021.

      4D-Labelfree蛋白組聯合4D磷酸化蛋白組學分析前列腺癌患者和健康個體尿液外囊泡,找到一系列疾病相關的磷酸化蛋白,表明其在臨床研究中的巨大應用潛力

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