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      定量蛋白質組 ? TMT蛋白質組學

      · 產品定義

      TMT 蛋白質組學(Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研發的一種多肽體外等重同位素標記的相對與絕對定量技術,采用6、10及16種同位素的標簽,通過特異性標記多肽的氨基基團,經高分辨質譜儀串聯分析,可同時比較多達16種樣品之間的蛋白質表達量,是標記定量蛋白質組學中的高通量篩選技術。

       

      · 技術路線

      技術路線

       

      · 技術優勢

      1. 同一批次標記的樣本統一處理,減少樣本處理及實驗誤差,實驗平行性較高

      2. 同一批次標記定量穩定性高

      3. 通過分級方法可大大增加蛋白鑒定深度

       

      · 數據分析

      標準數據分析內容

      鑒定分析

      鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖

      表達差異分析

      差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖;

      多組的比較分析(組別>=3

      mufzz聚類;雷達圖;箱線圖

      功能分析

      亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析

      質量控制分析

      肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布

      高級數據分析

      功能分析

      GSEA富集分析

      臨床藥物研究

      藥物靶點注釋

      標志物篩選

      集成機器學習

      與臨床表征的聯合分析

      熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析

      關于個性化數據分析需求,請來電咨詢

       

      · 推薦應用領域

      生物領域各個研究方面,如:

      1. 農林領域:抗逆脅迫機制,生長發育機制,育種保護研究等

      2. 畜牧業:肉類及乳品質研究,致病機理研究等

      3. 基礎醫學、臨床診斷:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,個性化治療等

      4. 生物醫藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發等

      5. 微生物領域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等

      6. 海洋水產:漁業資源,海水養殖,漁業環境與水產品安全等

      7. 生物能源、環境科學領域:發酵過程優化,生物燃料生產,環境危定風險評估研究等

      8. 食品營養:食品儲藏及加工條件優化,食品組分及品質鑒定,功能性食品開發,食品安全監檢測等

       

      · 送樣建議(特殊樣本可直接咨詢021-5466-5263/400-066-6761)

      樣品類型

      推薦樣本量

      動物組織類

      常規動物組織(腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉、皮膚等)

      30mg-2g

      植物組織類

      柔軟組織(木本植物的葉、花等,草本科植物,藻類,蕨類植物,大型真菌等)

      100mg-2g

      微生物類

      菌類

      50mg-2g

      細胞樣品

      懸浮/貼壁培養細胞

      1-10× 10^7

      體液樣本

      血清/血漿

      0.1ml-1ml

      外泌體

      提取完成的外泌體

      >100μg        

      其他類

      細胞上清

      5ml-10ml

       

      · 參考文獻

      1. NLRs guard metabolism to coordinate pattern- and effector-triggered immunity. 2021. Nature(IF 49.962)

      利用TMT蛋白質組等揭示水稻廣譜抗病性新機制,為抗病育種設計奠定理論基礎

      2. Construction of heparin-based hydrogel incorporated with Cu5.4O ultrasmall nanozymes for wound healing and inflammation inhibition. 2021. Bioactive Materials.(IF 14.119) 【客戶文獻】

      TMT蛋白組學助力研究一種新型水凝膠材料對炎癥抑制和傷口愈合的作用機制

      3.Prohibitin 2 deficiency impairs cardiac fatty acid oxidation and causes heart failure. 2020. Cell Death & Disease (IF 8.469)【客戶文獻】

      TMT蛋白組學揭示PHB2缺乏會損害心臟脂肪酸氧化反應并導致心力衰竭

      4.KIF5A-dependent axonal transport deficiency disrupts autophagic flux in trimethyltin chlorideinduced neurotoxicity. 2020. Autophagy. (IF 16.016) 【客戶文獻】

      TMT蛋白質組+PRM靶向驗證應用于三甲基氯化錫誘導的神經毒性機理研究

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