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      微生物測序 ? 宏基因組測序

      · 產品定義

      宏基因組學(metagenomics)以環境樣品中的微生物群體所有基因組作為研究對象,利用基因組學的研究策略研究環境樣品中所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能。

      與擴增子測序相比,宏基因組測序不僅對于物種鑒定精度更高,更能同時注釋KEGG、CAZy、COG、CARD等功能數據庫,獲得數倍于擴增子測序的微生物組組成及功能信息。

       

      · 技術路線

      技術路線

       

      · 技術優勢

      1. 樣本處理經驗豐富:糞便、內容物、土壤、水體、淤泥、發酵物等樣本

      2. 平臺優:基于優質的Illumina測序平臺,數據質量高

      3. 分析內容豐富:可選擇與各種代謝組學產品進行組學聯合分析

       

      · 數據分析

      數據分析

       

      · 部分數據分析結果展示

      部分數據分析結果展示

       

      · 推薦組合產品

      1. 宏基因組+代謝組:環境/宿主表型變化的微生物互作研究

      2. 宏基因組+16S:環境/宿主微生物群落結構和功能潛能研究

      3. 宏基因組+代謝組+轉錄組:宿主和微生物的協調響應機制研究

       

      · 推薦應用領域

      1. 代謝病研究:肥胖、糖尿病等代謝疾病與腸道菌群的關聯

      2. 腫瘤研究:腸道微生物調控腫瘤免疫作用機制

      3. 營養科學:功能性食品及畜禽飼料的功效機制研究

      4. 生物能源:生物質降解微生態研究

      5. 環境科學:污染物降解、耐性基因抗性分布等研究

       

      · 送樣建議(特殊樣本可直接咨詢021-5466-5263/400-066-6761)

      送樣建議

       

      · 項目案例

      文獻名稱:919 Syrup Alleviates Postpartum Depression by Modulating the Structure and Metabolism of Gut Microbes and Affecting the Function of the Hippocampal GABA/Glutamate System

      發表期刊:《Frontiers in Cellular and Infection Microbiology》(IF=5.293)

      合作單位:復旦大學附屬金山醫院

      文章摘要:產后抑郁癥(PPD)是一種影響世界各地孕婦的精神障礙,對母親、家庭和兒童均有嚴重后果。919糖漿作為一種中草藥,在臨床和實驗研究中已證明對治療產后抑郁癥有益,然而其作用機制尚不清楚。919糖漿經口攝入,使得藥物與腸道微生物群之間的潛在相互作用不容忽視。我們比較了對照健康對照小鼠、PPD小鼠和給藥PPD小鼠的海馬代謝和糞便代謝物水平和腸道菌群的變化,發現海馬中的4-氨基丁酸(GABA)以及多個關鍵腸道細菌種類與PPD行為相關,并確定了潛在的PPD小鼠腸道微生物群功能的代謝標記物(蛋氨酸精氨酸、尿毒酸、硫代乙醚酰胺PC、L-哌啶酸和亞油酸乙醇酰胺)。

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